Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms