Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRCP1A6NGW2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRCP1A6NGW2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms