Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HELTA6NFD8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms