Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms