Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA8A3KMH1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms