Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 OR4A19P-201ENST00000533579 1103 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 ST3GAL3-237ENST00000533933 834 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 LMO3-222ENST00000540445 906 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 MIR3680-2-201ENST00000578247 87 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 MIR3680-1-201ENST00000581433 87 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AP005202.1-202ENST00000583065 748 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 G6PC-204ENST00000592383 987 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 SATB1-AS1-212ENST00000596152 610 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AL121830.1-203ENST00000598694 701 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC004840.2-201ENST00000603368 285 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 uc_338.3-201ENST00000613268 181 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 Metazoa_SRP.74-201ENST00000614973 284 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC092329.4-205ENST00000638822 574 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 ADGRE1-205ENST00000450315 2567 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 ADA2-204ENST00000399839 3986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 LY86-AS1-201ENST00000429345 1941 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 CKAP2-203ENST00000378037 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 FGG-203ENST00000404648 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 ZNF701-201ENST00000301093 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 THAP12P6-201ENST00000431978 2310 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 ANKS1B-211ENST00000547776 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AL049842.1-201ENST00000402902 1479 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 CDH13-210ENST00000567445 1456 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AL589642.1-201ENST00000430787 2582 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 GTF2H1-201ENST00000265963 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 MS4A10-201ENST00000308287 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 VIT-202ENST00000379242 2810 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC024132.1-201ENST00000382007 2509 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC068044.1-201ENST00000441585 1978 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 C7-201ENST00000313164 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 MAP3K13-203ENST00000424227 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 TMEM52B-203ENST00000381923 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 TTTY8B-201ENST00000328819 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 TTTY8-201ENST00000329684 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 OR6B1-201ENST00000408922 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 RMDN2-AS1-201ENST00000414365 859 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 BX470209.1-201ENST00000421297 916 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC011999.1-201ENST00000424794 1024 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 C5orf67-201ENST00000438651 765 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 LMNTD1-203ENST00000445693 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AL353194.1-201ENST00000451507 441 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 PGA5-202ENST00000451616 971 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 FTLP18-201ENST00000453860 523 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 SNX18P4-201ENST00000456554 838 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 HNRNPCP10-201ENST00000457130 884 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 RPS28P7-201ENST00000473748 210 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 RN7SL659P-201ENST00000483093 299 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC011294.1-201ENST00000487094 844 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 ACOT9-207ENST00000492081 683 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 GUSBP3-201ENST00000509348 423 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 LINC01095-203ENST00000512063 1175 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 IGHVIV-44-1-201ENST00000519334 338 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 ATOX1-202ENST00000520382 466 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 FLJ46284-203ENST00000521230 407 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 ZNF195-220ENST00000528796 881 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 ENSAP2-201ENST00000554405 352 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC012414.3-201ENST00000559621 748 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 OR7D1P-201ENST00000592739 933 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC018695.4-201ENST00000602706 689 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC093726.2-201ENST00000609134 679 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AL354740.1-202ENST00000612837 290 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AL354718.2-201ENST00000618030 371 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 NF1P9-202ENST00000629550 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 ZNF493-201ENST00000339914 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 LDB3-201ENST00000263066 3873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 NUGGC-201ENST00000413272 3887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AL049833.3-201ENST00000623920 3738 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms