Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AP000867.1-201ENST00000511464 255 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 GOT1L1-202ENST00000518826 497 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC022730.3-201ENST00000521051 736 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 ATOX1-206ENST00000522710 591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 OR1D4-201ENST00000525719 939 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC027688.1-201ENST00000568471 584 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 OR1D5-201ENST00000575751 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 CD160-204ENST00000584442 219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC013290.1-201ENST00000586960 537 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 U62631.1-201ENST00000597110 435 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 CEACAM8-202ENST00000599005 544 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AL354872.2-201ENST00000607679 466 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC107294.2-201ENST00000610001 701 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 Metazoa_SRP.110-201ENST00000611670 282 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 FP565260.4-201ENST00000624081 513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC009108.3-201ENST00000602739 3515 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 TP63-204ENST00000392460 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 ZNF225-204ENST00000590612 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 SNX27-201ENST00000368838 1308 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 MS4A6A-203ENST00000426738 1736 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 KCNJ15-221ENST00000613499 3049 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 HPRT1-201ENST00000298556 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AL049840.1-201ENST00000498989 1404 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 ELP3-219ENST00000537665 3053 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AMBN-202ENST00000449493 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 TMEM169-201ENST00000295658 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AL390195.2-201ENST00000564771 2023 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AL162632.3-201ENST00000566976 1625 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 ATXN3-203ENST00000393287 6770 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC104447.1-201ENST00000624214 2124 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC078881.1-201ENST00000507023 2161 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 RNASE9-207ENST00000555230 2668 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 ABRAXAS1-208ENST00000515303 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 VPREB1-201ENST00000302273 626 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 TAC1-202ENST00000346867 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 LAIR2-202ENST00000351841 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 LINC00970-201ENST00000366408 1129 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 CENPW-201ENST00000368325 528 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 FRG1JP-201ENST00000376334 931 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AL512430.3-201ENST00000405355 441 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 VN1R11P-201ENST00000407795 868 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 RNU4-86P-201ENST00000410135 219 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AL589763.1-201ENST00000412257 791 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC016027.1-201ENST00000426483 805 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 RPL36A-203ENST00000427805 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 DAB1-AS1-203ENST00000432897 656 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC244205.2-201ENST00000434790 898 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 LSMEM1-202ENST00000439068 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 S100A13-204ENST00000440685 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AL109933.1-201ENST00000448126 292 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC119428.2-201ENST00000449958 850 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC022701.1-201ENST00000462935 622 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC009078.1-201ENST00000474978 783 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC233724.8-201ENST00000504574 234 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC084357.2-201ENST00000509615 275 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC233724.3-201ENST00000512613 128 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 RAB2A-208ENST00000529579 680 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC023511.1-201ENST00000549055 571 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 C14orf166-206ENST00000556760 851 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 SHBG-209ENST00000572182 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 PRKAR1A-214ENST00000588188 1209 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 HDAC1P2-202ENST00000602936 807 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 MIR6831-201ENST00000617240 81 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 FTX_5.1-201ENST00000618701 218 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 IPO4-221ENST00000625289 297 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC021683.2-203ENST00000591283 4902 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 BCO2-201ENST00000357685 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 RORA-202ENST00000309157 1908 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC133485.2-201ENST00000566232 2484 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 XAF1-202ENST00000361842 3623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 WDR31-203ENST00000374195 3101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 CYFIP2-221ENST00000618329 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 PPP2R2B-211ENST00000508545 2042 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 ZNF410-205ENST00000442160 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 SHQ1-203ENST00000463369 2065 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 WDR75-201ENST00000314761 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms