Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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