Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP15Q9Y4E8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP15Q9Y4E8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms