Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R0

GRIP1, Glutamate receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP1Q9Y3R0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIP1Q9Y3R0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIP1Q9Y3R0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIP1Q9Y3R0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIP1Q9Y3R0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIP1Q9Y3R0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIP1Q9Y3R0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIP1Q9Y3R0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms