Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNND2Q9UQB3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms