Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPCAL4Q9UM19 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms