Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENND2AQ9ULE3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms