Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
USP21Q9UK80 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP21Q9UK80 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms