Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms