Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms