Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CABP1Q9NZU7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms