Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PODXL2Q9NZ53 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms