Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
COA4Q9NYJ1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COA4Q9NYJ1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms