Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms