Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWK9

ZNHIT6, Box C/D snoRNA protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT6Q9NWK9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNHIT6Q9NWK9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT6Q9NWK9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms