Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM30AQ9NV96 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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