Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms