Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP3Q9NS15 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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