Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
DUOX2Q9NRD8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms