Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCB9Q9NP78 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCB9Q9NP78 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms