Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM12Q9H4Q4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms