Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms