Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms