Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUS3Q9BZE2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms