Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA3Q9BQP9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms