Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms