Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3Q99687 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS3Q99687 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms