Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC5LQ99459 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms