Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms