Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC43Q96MW1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms