Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NSMCE2Q96MF7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms