Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX27Q96L92 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms