Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms