Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RUNDC1Q96C34 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUNDC1Q96C34 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms