Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms