Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT35Q92764 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT35Q92764 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT35Q92764 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT35Q92764 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT35Q92764 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT35Q92764 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT35Q92764 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT35Q92764 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT35Q92764 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT35Q92764 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT35Q92764 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT35Q92764 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT35Q92764 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT35Q92764 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT35Q92764 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT35Q92764 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT35Q92764 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT35Q92764 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT35Q92764 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT35Q92764 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT35Q92764 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT35Q92764 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT35Q92764 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms