Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOPBP1Q92547 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
TOPBP1Q92547 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms