Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms