Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms