Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00301Q8NCQ3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00301Q8NCQ3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms