Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NME8Q8N427 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME8Q8N427 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms