Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms