Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPER4Q7RTX7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms