Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
BRINP3Q76B58 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms